Помимо трудовых отношений, которые регулируются ТК РФ, организация может вступать с физическими лицами в отношения, которые регулируются Гражданским Кодексом Российской Федерации.

В соответствии со статьей 702 ГК РФ по договору подряда одна сторона (подрядчик) обязуется выполнить по заданию другой стороны (заказчика) определенную работу и сдать ее результат заказчику, а заказчик обязуется принять результат работы и оплатить его. В рассматриваемом контексте подрядчиком является физическое лицо, а заказчиком - организация.

Для регистрации условий договора гражданско-правового характера на выполнение работ или оказание услуг с целью последующего начисления вознаграждения сотруднику но нему предназначен документ Договор (работы, услуги).

Фактические начисления сумм вознаграждений по договору, а также НДФЛ и страховых взносов с этих сумм, производятся в документе Начисление зарплаты, который заполняется автоматически в соответствии с зарегистрированными условиями договора.

В качестве сотрудника может быть выбран, в том числе, сотрудник, с которым ранее уже был заключен трудовой договор.

Указание периода договора является обязательным. В соответствии с указанным периодом определяется стаж при автоматическом заполнении отчетности в ПФР.

Оплата по договору, как правило, может производиться либо однократно по окончанию договора, либо ежемесячно по актам выполненных работ, при этом каждый месяц суммы могут быть разными.
Если договор оплачивается первым способом (однократно в конце срока), то сумма, указанная в нем, автоматически попадает в документ Начисление зарплаты в том месяце начисления, куда входит дата окончания договора.

В этом случае печатную форму акта можно сформировать непосредственно из самого договора.
Если договор оплачивается вторым способом (по актам выполненных работ), то для фактического начисления сумм необходимо зарегистрировать специальный документ Акт приемки выполненных работ. Рекомендуется создавать этот документ на основании договора, т.к. в этом случае большинство его полей заполняются автоматически.

При исчислении НДФЛ с сумм вознаграждений по договору может применяться вычет в размере сумм понесенных расходов. При первом способе оплаты эта сумма может быть указана непосредственно в договоре, при втором – в акте. В последующем сумма вычета может быть указана или уточена непосредственно в документе Начисление зарплаты.

В договоре можно указать особенности его отражения в учете – подразделение, на которое будут списываться затраты по этому договору и способ отражения (счет, субконто). Предусмотрено формирование типовой печатной формы договора.