Предприятие, учет которого ведется в программе, может быть представлено как одним юридическим лицом (или физическим, имеющим наемных сотрудников), так и несколькими. Любое такое юридическое или физическое лицо в программе называется организацией и описывается в справочнике Организации. Таким образом, под предприятием понимается одна или несколько организаций.

Если предприятие состоит из одной организации, то при работе с программой (при вводе документов и т. п.) нет необходимости явно указывать в них организацию. Поле для указания организации не показывается в формах. При добавлении в программу сведений о второй организации поле автоматически начинает отображаться во всех формах, где требуется выбор организации, и становится возможным просмотреть список организаций.

Если предприятие состоит из нескольких организаций, то его учет можно вести как в одном приложении, так и в нескольких независимых, разделенных по числу организаций или по некоторым произвольным комбинациям организаций.

Объединять учет нескольких организаций удобно, если они тесно связаны между собой. В общем приложении однотипные сведения, используемые разными организациями, например, персональные данные сотрудников, начисления и удержания, требуется вводить один раз.

Даже если в одном приложении ведется учет нескольких организаций, то имеется возможность определенным пользователям предоставить доступ только к определенным организациям.