В командировки направляются сотрудники, состоящие в трудовых отношениях с работодателем (п. 2 Положения об особенностях направления работников в служебные командировки). Срок командировки определяется работодателем с учетом объема, сложности и других особенностей служебного поручения (п. 4 Положения).
Направление сотрудника в служебную командировку оформляется приказом по предприятию по форме № Т-9 или № Т-9а. До 2015 года приказ заполнялся на основании служебного задания, в котором указывалась цель поездки.

Также до 2015 года вместе с приказом и служебным заданием работодатель выписывал сотруднику командировочное удостоверение, которое находилось у сотрудника в течение всей служебной поездки и подтверждало срок нахождения его в командировке (дату приезда в пункт назначения и дату выезда из него). Командировочное удостоверение оформлялось по унифицированной форме № Т-10. В настоящее время командировочное удостоверение оформлять не надо.

С 2015 года отменена обязанность сотрудника представлять работодателю отчет о проделанной в командировке работе. При возвращении из командировки сотрудник должен предоставить работодателю только авансовый отчет с документами, подтверждающими расходы, произведенные в командировке (п. 26 Положения).

Для регистрации и расчета оплаты командировки сотрудника и для оформления соответствующего приказа по унифицированной форме Т-9 предназначен документ Командировка

Основным условием командировки является ее период. Для расчета достаточно указать дату начала и окончания. Период указывается полностью, включая дни нахождения сотрудника в пути.
Командировка в программе оплачивается за дни (или часы), которые являются рабочими по установленному сотруднику графику работы (в том числе индивидуальному).

Командировка может приходиться на выходные или праздничные дни, и может потребоваться их оплатить согласно законодательству, например, если сотрудник в эти дни действительно работал в командировке. В этом случае факт работы в такие дни и необходимость их оплаты можно зарегистрировать отдельным документом Работа в выходные и праздничные дни.

Если в настройках расчета зарплаты была выбрана возможность регистрировать внутрисменные командировки, то доступен флажок Командировка на неполный день (внутрисменная). Его установка позволяет указать период командировки не в целых днях, а в часах в пределах выбранного дня.

Если согласно графику работы сотрудника в этот день предусмотрена работа с разным видом времени (например, в дневное и ночное время), то можно уточнить, на какое именно время придется внутрисменное отсутствие сотрудника. Это позволит правильно рассчитать оплату за разные виды времени.

Если в программе ведется штатное расписание, то с помощью одноименного флажка можно в нем освободить ставку на период отсутствия сотрудника. В этом случае в отчетах по штатному расписанию (за период отсутствия) ставка будет показываться как свободная, а также на эту ставку будет возможен прием другого сотрудника без выдачи сообщения при проверке.

Для оформления командировок нескольких сотрудников и печати соответствующего списочного приказа по унифицированной форме Т-9а предназначен документ Командировка группы