Если зарплата при перечислении в банк (в рамках зарплатного проекта либо на личные счета) зачислена сотрудникам полностью, то никаких дополнительных отметок в ведомостях на выплату делать не потребуется.

Если зарплата зачислена не полностью, то на основании ведомости на выплату можно ввести документ "Сведения о незачисленной зарплате". При этом в документе указывается: дата, когда поступила информация о незачислении денег; ведомость, на основании которой производится возврат сумм; конкретный сотрудник (либо сотрудники), которым зарплату не зачислили.

При проведении документа зарплата сотрудникам считается невыплаченной (т.е. как задолженность организации перед сотрудником). При устранении проблем с банком остаток может быть выплачен в последующем по отдельной ведомости, созданной за этот месяц позже (либо суммы к выплате будут учтены при выплате за следующий месяц).